无异元来禅师，无明慧经禅师之法嗣，俗姓沙，庐州（今安徽境内）舒城人，生于大明神宗万历三年（1575）。元来禅师十六岁游金陵，一日于瓦棺寺听讲《法华经》，遂生出世之志，于是前往五台山，投静庵通禅师座下出家。静庵通禅师传授给他天台三观之旨，并嘱咐他好好修习。元来禅师于是谨遵师教，精勤修习止观法门，达五年之久。后前往超华山，从极庵洪禅师比丘戒。
当时，无明慧经禅师正在峨嵋山，大唱曹洞法门，学者奔凑。元来禅师听说之后，遂前往礼谒。刚到峨嵋，适逢慧经禅师正要下地劳作，荷锄戴笠，状如农夫，元来禅师对他的修为颇为怀疑，当即便离开了峨嵋山，来到福建光泽县的白云峰，卓庵隐修三年。在这期间，元来禅师写成《心经指南》，让人捎给慧经禅师。慧经禅师阅后，写信告诉他说，所著“非其第一义”。元来禅师羞愧万分，于是将其手稿付之一炬，然后向慧经禅师所在的方向，焚香遥拜，决心从此以后放弃文字知解，潜心宗门。于是他又独自继续呆在庵中，参究了半年，无有省发。
一日，元来禅师偶然翻阅《传灯录》。当他读到“赵州嘱僧曰：‘有佛处不得住，无佛处急走过’”这段文字时，恍然有省。于是元来禅师便重新前往峨嵋，参礼慧经禅师。当时慧经禅师已经移住宝方。
于是，元来禅师又赶到宝方。在宝方，元来禅师住了两个月。为了克期取证，元来禅师用功非常勤苦，虽面目黧黑，憔悴骨立，却仍然不肯歇息。
一日，慧经禅师应玉山庵之邀请，前往说法，元来禅师奉命同行。一路上，元来禅师谈及君臣五位之旨，慧经禅师听了，不时地称可。可是快要达到玉山庵的时候，慧经禅师忽然问元来禅师：“佛印大师云：‘蚁子解寻腥处走，青蝇偏向臭边飞’，是君位事，臣位事？”
元来禅师道：“臣位事。”
慧经禅师一听，便呵斥道：“大有人笑汝在！”
元来禅师茫然莫测其旨，心中迷闷不已。
到达玉山庵之后，元来禅师终日独坐于一小楼中，朝夕提撕，目不交睫。这样过了一年多。
一日，元来禅师上厕所，准备方便，碰巧看见有一个人正蹲在木板上。他当即豁然大悟，身心踊跃，喜不自胜，如千斤重担突然落地。
于是，他一路奔跑，往见慧经禅师。慧经禅师的居处，离宝方寺虽有五十里之遥，可是元来禅师却感觉到须臾即至。
刚进丈室，元来禅师便展礼大拜。
慧经禅师问道：“子近日如何？”
元来禅师道：“有个活路不许人知。”
慧经禅师道：“因甚不许人知？”
元来禅师道：“不知！不知！”
慧经禅师一听，非常高兴。于是令他充当首座和尚，并赠以付法偈。
当时，元来禅师才二十七岁。
元来禅师得法后不久，便前往鹅湖，从养庵广心禅师受菩萨戒律，后出世于博山能仁寺，大弘禅化，望风归学者数以千计。
元来禅师圆寂于崇祯三年（1630），春秋五十六岁。生前著有《宗教通说》、《参禅警语》等行世。
元来禅师的《参禅警语》，言简意赅，言无虚发，对如何参禅、做功夫，作了简明而中肯的开示，堪称学道者“参禅指南”。现摘其大要如次，供读者参考——
Ｏ学者先发破生死之心，要观破世界身心，皆为假缘无实。Ｏ要疑生从何来，死向何去。Ｏ死之一字贴在额上，如一身全死去。Ｏ不得耽著静境。Ｏ不得循人情。Ｏ全身一个疑团，不见天，不见地，不见山，不见水，一切可亡。Ｏ工夫不怕不得活，怕不得死，要疑情成一团而大死着。Ｏ举起话头时，如猫之捕鼠，无一毫别念。Ｏ不可在古人公案上卜度，妄加解释。Ｏ自心是佛名正信，心外取法名邪信，究明自心，亲履实践，至不疑之地。Ｏ若真话头现前时，履冰不寒，蹈火不热，不为境转，打成一片也。Ｏ寻文逐句，记言记语，害工夫，工夫要心行处绝。Ｏ工夫怕比量，将心凑泊，与道相远。Ｏ工夫在切之一字。Ｏ用心真切，则不思善，不思恶，无昏沈，不掉举。Ｏ思维莫作诗偈文赋，与参禅相迷。Ｏ工夫忌落空。Ｏ勿将心待语，时节因缘必大悟。Ｏ无可用心处，到万仞悬崖之处，有转身之分。Ｏ工夫不得有伶俐心，如盲如聋，如撞着银山铁壁。Ｏ工夫要知非，知非是出死之要路。Ｏ工夫虽得轻安，或有省发，不可以为悟。Ｏ不可作道理之会，不可作无事之会，不可作击石火闪电光之会。Ｏ遏捺妄心不起，莫守澄湛之地。Ｏ莫以观一切法空为禅。Ｏ莫认无形无相之一物。Ｏ莫认自己一灵之真性为眼见耳闻。Ｏ莫以苦行为解脱。Ｏ莫以烧身燃臂礼佛求忏为功课。Ｏ莫散淡去、活泼去，逢人则歌舞欢乐，吟咏笑谈，或横行街市，以为了事。Ｏ见与法身之理相应，见尽大地光皎皎地，不可坐住著。Ｏ与法身之理相应，莫休歇去、沉寂去。Ｏ与法身之理相应，莫认眼前隐隐有一物。Ｏ与法身之理相应，见光，见华，见种种异相，莫作圣解。Ｏ与法身之理相应，四大轻安，正偏道交，莫以作究竟。