人体肠胃是人体的第二大脑，它的健康状况影响着人体的喜怒哀乐。
健康人的胃肠道内栖居着数量庞大、种类繁多的微生物，这些微生物统称为肠道菌群。
肠道菌群按一定的比例组合，各菌群间互相制约、互相依存、受饮食、生活习惯、地理环境、年龄及卫生条件的影响而变动，在质和量上形成一种生态平衡。
消化道内特定量的有益微生物，以维持消化道内的平衡和养分的消化吸收，因为益生菌在维持肠道菌群平衡乃至胃肠道健康中起着决定性的作用。
肠道健康标准
关于肠道健康的五项主要标准
肠道健康征象
食物消化和吸收正常，营养状况正常，有效吸收食物、水和矿物质，肠道运动节律、通过时间正常，无腹痛、腹胀；粪便正常，无恶心、呕吐、腹泻、便秘和腹胀。
胃肠道无疾病 无胃酸性疾病，无胃食管反流或其他的胃肠炎症性疾病；
无酶缺乏或糖类不耐受；
无炎症性肠病、乳糜泻或其他炎症性疾病、无结肠直肠或其他胃肠肿瘤
肠道微生态正常稳定 无细胞过度生长，肠微生物组成和活力正常；
无胃肠感染或抗生素相关性腹泻
正常的免疫功能 胃肠粘膜屏障正常，黏液分泌正常，无细菌易位；IgA水平正常，免疫细胞的数量和活性正常；免疫耐受，无过敏或黏膜高反应性
健康状态 生活质量高，或肠道舒适度正常；5-羟色胺分泌正常，肠神经系统功能正常
人体胃肠道是益生菌定植并发挥作用的主要场所，益生菌在肠道微环境中进行代谢活动，影响人体的食物药物成分代谢、细胞更新、免疫反应等诸多生理活动。
益生菌具有缓解便秘、乳糖不耐受症和减少术后综合征的疗效；
益生菌的抑菌活性可以有效地减少胃肠道中的病原菌和感染性疾病；
体内体外试验也显示了益生菌抗结肠癌和术后肠道改善的效果。
这些进一步表明益生菌为现有的胃肠道治疗领域提供了一个选择性的方法。
然后，各种临床试验表明，益生菌的影响根据不同的益生菌菌株、配方、剂量和对象而异，此外，其预防的效果要远远好于治疗的效果。
二、益生菌治疗各种胃肠道疾病的研究进展
1、益生菌抑制和缓解腹泻；
2、益生菌缓解乳糖不耐受；
3、益生菌治疗肠道易激综合征；
4、益生菌治疗炎症性肠炎；
5、益生菌能改善便秘；
6、益生菌抗结肠癌；
7、益生菌辅助治疗幽门螺杆菌；
8、益生菌改善大肠癌术后患者肠道屏障功能。
三、益生菌促进胃肠道的机制
1、益生菌与肠道屏障作用
肠道屏障和胃肠微生物是保证肠道健康的两个主要因素。
益生菌能调节肠道上皮细胞的功能。
2、益生菌能调节宿主的免疫功能
除了增强物理屏障作用，共生菌和补充的特殊益生菌能够增加小肠黏液的分泌，促进免疫屏障功能。
另外，通过调节免疫细胞生成促炎反应细胞素或抗炎反应细胞素，益生菌也可以实现免疫调节。
3、益生菌能产生抑菌物质
大多数益生菌，尤其是乳酸菌，耐酸、适应肠道生态环境，便于在人畜肠道内繁衍增殖。在健康人畜的肠道中，各种细菌的种类、数量和定居部位是相对稳定的，它们互相协调。互相制约。共同形成一个微生态系统。
益生菌能够抑制病原菌的生长，促进双歧杆菌、嗜酸乳杆菌、粪链球菌的生长。
4、益生菌抑制肠道病原菌的入侵和定植
益生菌与致病菌竞争肠道黏膜表面的结合位点，然后定植于肠道内，这可能是益生菌发挥其功能的抑制之一。
幽门螺旋杆菌的黏附也可被益生菌所抑制。
近三十年来，益生菌制剂的研制取得了较大的进展，并广泛应用于临床研究，借以调节人体内微生态群落或种群结构，保持菌群平衡，促进内环境的稳定，提高宿主的健康状态。对消化系统疾病的防治起到一定的作用。
益生菌制剂可以直接或间接地通过调节内源性的微生态系统或免疫系统作用于肠道。