九股金刚杵上有一个中轴股叉和八个弯曲的外股叉，它们直接插在金刚杵两端的四大基本方位和四小基本方位上。八个外股叉同样从摩羯嘴伸出，象征着八识[1]和引导人们摆脱轮回之苦的佛陀的八正道。中央股叉和四大方位的上股叉代表着五佛，而四小方位上的股叉代表着四佛母，即：占据四方之四佛的女性伴偶。中央和四个较低位置上的股叉代表五佛智，而四小方位的股叉代表四无量。九股金刚杵基本上象征着对宁玛派九乘[2]的彻悟。九股叉也象征着八大菩萨簇拥下的金刚持、佛陀及其八正道和坛城的主要中心和八大方位。
在更神秘的层面上，金刚杵这个象征物经常是众多神灵生成时所使用的直观修持的前奏。此时，将第一个种子符号画成生成于空性，或出现在修持者的面前或在他们心中。随后，这个种子符号融入光中，以八瓣莲花的形状显现，并在莲花上生成日月圆盘。另一个种子符号从这个圆盘上升起，然后，变成一个金刚杵，其中心有另一个种子符号。最后，这个金刚杵又变成神的化身。种子符号显现的三个阶段被称作金刚三昧[3]。第一阶段，种子符号从空性中产生；第二阶段，生成修持者的智慧或金刚心；第三阶段，金刚智度心转化成神的化身。从象征意义上来说，莲花用八个莲瓣代表心轮[4]；日月圆盘作为方便和智慧代表着红白滴露，是相对和绝对菩提心露的结合。金刚杵中股叉垂直延伸的部分代表着中脉，周围的八个股叉代表生成心轮的八大脉道。在中心点两侧的三个圈代表符号，代表着心中的金刚滴露。修持者从这个金刚滴露中生成的觉识成为所观修之神的明相。
同样，在金刚乘神殿众多的神灵中，每一位神都被说成出自五佛部，每位神都冠以自己独特的佛部手印。善相神头顶上常绘有其父佛陀的小像或他的种子符号，而怒相神头顶的顶冠上更常画有半截金刚杵，中央点上绘有其父佛陀的种子符号。
[1] 梵文：astavijnana;藏文：shes-pa brgyad：八识，唯识说所立的八种识，即：1）眼识；2）耳识；3）鼻识；4）舌识；5）身识；6）意识；7）未那识；8）阿赖耶识。
[2] 梵文：yana，乘，是车乘，泛指能使人觉悟得度得教法。九乘是：1）声闻；2）独觉；3）菩萨；4）事部；5）行部；6）瑜伽部；7）大瑜伽；8）随类瑜伽；9）最极瑜伽或大圆满。
[3] 金刚三昧，亦称金刚喻定、金刚定。三乘的修行者最后断除一切烦恼而得究竟果的三昧。
[4] 原文：heart chakra，心轮。