这三种智慧：般若的总相智、别相智以及种智，这三种智慧不共二乘，所以称为别教；前两智是人无我--就是大乘所说的般若--般若的总相智；别相智是人无我--禅宗的祖师们悟后去行脚参访诸方大善知识增益权智，就是在般若的别相智上去增益；我们对见性之同修开示禅门差别智，也是般若智的别相智，所以前两种智慧是大乘人无我--从真如的总相及别相来现观我的五蕴、众生的五蕴，我的十二处、众生的十二处，我的十八界、众生的十八界统统无常、缘起，其性是空，这是大乘人无我智依真如而做现观。
至于后面的百法明门种智就是法无我智，是禅宗证悟者悟后所应修学的；犹如这里有许多位很早就破参了，如今在跟我学种智法无我的智慧。但种智与别相智、总相智之间的关系如何呢？凡是通达种智的人一定通达别相智，通达别相智者一定通达总相智；通达总相智则不一定通达别相智，所以在禅三刚破参回来的你，遇见五六年前破参的同修，他们也从总相上说真如时，有时你也会听不懂；这就是人家有别相智而你没有别相智，只有总相智--你只知一个总体而已，不知别相。
可是这破参五六年的人听到三十、二十年前破参，已经入初地证得法无我的人，在讲增上慧学时，他又有些听不懂了：什么等无间缘、所缘缘，从来都没听过，结果听不懂。可是这位少分证得法无我的人，他能懂得你在和人家讲别相智的内容；你在和人讲别相智时，那个证得总相智的人则有可能听不懂，但是那位少分证得法无我的人在旁边微笑看著你，跟你点点头，也许他偶尔向那位证得总相智的人轻微的、让他不知不觉的摇一下头，意思是说：“他悟的还很浅，要赶快精进用功。”这也就是说：总相智是根本基础，没有总相智就不能证得别相智，没有别相智就不能证得种智；证得种智能知别相智，证得别相智能知总相智，这是三智之间的差别相。
这种般若慧与二乘法又有关连：证得总相智的人，不久之后会渐渐了解二乘法之内容--只要将二乘经典阿含诸经读过就知道了；所以我破参没几年就讲《悟前与悟后》那本书--那是一九九三年讲，到一九九五年才出版--那时已经读过阿含四部，已知二乘法，所以就讲二乘入道初门差别：声闻乘的见道、缘觉乘的见道、大乘的见道是不相同的。通般若时，只要有总相智，不用多久就会通达二乘；因二乘之法是断我见后，由断烦恼上苦修实修，在般若上，他们没什么好谈的--因为没有证得自心真如；他们没有般若，只有声闻菩提、缘觉菩提。
大乘总相智通达了，迟早一定会知道二乘法；可是二乘人即使成为阿罗汉无学位，也不知大乘七住菩萨明心的般若究竟是什么？因为不晓得你所悟是悟什么？那也就是由于大乘菩萨已经证知真如的本来自性清净涅槃--证知涅槃的本际，所以还没有取证无余涅槃、还没进入有余涅槃位，就已经知道解脱是什么，知道无余涅槃境界是什么。而二乘无学乃至成为阿罗汉还不知涅槃本际；入了涅槃以后也不知道，因为入涅槃时他的“觉知心我”已经消失掉了。所以菩萨证悟大乘人无我以后，必定渐渐通达二乘法，可是二乘无学阿罗汉、辟支佛证悟二乘人无我，却无法通达大乘法。