东方三圣
药师灌顶真言（又称药师琉璃光如来灌顶咒） ：
那谟薄伽筏帝，裨杀社窭噜，薛琉璃钵剌婆喝啰阇也，怛陀揭多耶，阿罗诃帝，三藐三勃陀耶。怛侄阤：唵，鞞杀逝，鞞杀逝，鞞杀社，三没揭帝娑诃
效用：能消灾除病，增福，消罪业，回复戒体清净，退度灾星，随心满善愿，驱除邪魔，破恶咒术，导邪归正，乃至拔度生生过罪，饶益诸天护法，速证菩提，恒常受持命终药师佛与二菩萨诸大圣众前来接引令生琉璃世界，现世未来永不退转，直至成佛，无诸障碍。
药师佛心咒（藏传）
药师佛心咒(注音):
die ya ta ong bei kan ze bei kan ze ma ha
喋 雅 他嗡，贝 堪 则贝 堪 则，玛哈
bei kan ze la za sa mu ga die so ha
贝 堪 则，拉杂萨目，嘎喋 梭哈。
效用：此咒功德，专除病苦，增寿命，免夭折，并能消除一切罪业，命终往生东方清净琉璃世界，永不退转，直至成佛，亦度亡者不可少之咒也。
日光菩萨咒 ：
南无勃陀瞿那迷。南无达摩莫诃低。南无僧伽多夜泥。底哩部毕咄檐纳摩。
效用：诵此咒灭一切罪，亦能辟魔及除天灾，若诵一遍，礼佛一拜，如是日别三时诵咒礼佛，未来之世所受身处，当得一一相貌端正可喜果报。
月光菩萨咒 ：
深低帝屠苏咤。阿若蜜帝乌都咤。深耆咤。波赖帝。耶弥若咤乌都咤。拘罗帝咤耆摩咤。沙婆诃。
效用：此咒五遍，取五色线作咒索，痛处系，此咒乃是过去四十恒河沙诸佛所说，我今亦说，为诸行人作拥护故、除一切障难故、除一切病痛故、成就一切诸善法故、远离一切诸怖畏故。
此陀罗尼能大利益三界众生；一切患苦萦身者，以此陀罗尼治之，无有不差者。
此大神咒，咒干枯树，尚得生枝柯华果，何况有情有识众生，身有病患治之不差者，必无是处。