2013年4月25日，中国佛教协会副会长、河北省佛教协会会长、湖北省佛教协会名誉会长、黄梅四祖寺方丈、五祖寺方丈、邢台大开元寺住持净慧长老追思大会、荼毗法会在湖北黄梅四祖寺举行。来自中央统战部、国家宗教事务局、湖北省、河北省相关部门的领导，以及海内外的诸山长老、四众弟子万余人参加追思大会，为净慧长老送行。
国家宗教事务局副局长蒋坚永，中共中央统战部二局副局长张天昱，国家宗教事务局一司司长刘威，中共湖北省委常委、统战部部长张岱梨，湖北省人大常委会副主任周洪宇，湖北省人民政府副省长王君正，湖北省政协副主席郑心穗，中共湖北省委统战部副部长，省民宗委主任柳望春，湖北省政府副秘书长聂昌斌；中共河北省委统战部副部长刘青，河北省民宗厅厅长陈会新，河北省政协副主席曹素华，河北省政协民宗委主任杜宪光，中共河北省委邢台市委常委、统战部部长王素平；中共黄冈市委常委、统战部部长刘海军等黄冈市相关领导；净慧长老家乡代表、武汉市新洲区政协主席王建生，中共黄梅县委***余建堂、县长马艳舟等相关部门领导出席追思大会。
中国佛教协会会长传印长老，中国佛教协会咨议委员会副主席、江苏省佛教协会名誉会长松纯长老，中国佛教协会咨议委员会副主席、江苏省佛教协会名誉会长无相长老，中国佛教协会副会长、云南省佛教协会会长刀述仁，中国佛教协会副会长、四川省佛教协会会长永寿法师，中国佛教协会副会长、河南省佛教协会会长永信法师，中国佛教协会副会长、广东省佛教协会会长明生法师，中国佛教协会副会长、江西省佛教协会会长纯一法师，中国佛教协会副会长、湖北省佛教协会会长正慈法师，中国佛教协会副会长、海南省佛教协会会长印顺法师，中国佛教协会秘书长王健，上海市佛教协会办公室主任金易明教授等来自全国各地的佛教界人士出席追思大会；北京大学宗教研究所所长楼宇烈教授等专家学者代表出追思大会。
当天，各级领导、诸山长老、法师、净慧长老弟子学子、护法居士、信众等近万人送别净慧长老。
追思大会由中国佛教协会副会长、湖北省佛教协会会长正慈法师主持。首先全体肃立，为净慧长老默哀一分钟，向净慧长老法相三鞠躬。
国宗局副局长蒋坚永宣读***常委、全国政协主席俞正声，***委员、国务院副总理刘延东，原***常委、全国政协主席贾庆林唁电。中共中央统战部二局副局长张天昱宣读全国政协副主席、中共中央统战部部长令计划唁电。湖北省人民政府副省长王君正宣读湖北省委***李鸿忠、省长王国生唁电。河北省政协副主席曹素华宣读河北省委***周本顺、省长张庆伟唁电。
净慧长老圆寂后，各级组织，各级领导、各界人士、广大信众都以不同方式表示深切哀悼，原***常委、全国政协主席李瑞环送来花圈，原***委员、全国人大副委员长王兆国表示慰问。
中共中央统战部，国家宗教事务局，全国政协民宗委，中国佛教协会，中国道教协会或送来花圈，或发来唁电哀悼。中共中央统战部常务副部长张裔炯、中央社会主义学院第一副院长叶小文、国家宗教事务局局长王作安送花圈悼念；中国佛教协会名誉会长一诚长老等各级党政部门、领导和各佛协组织、领导及居士送花圈悼念净慧长老；专家学者方立天教授、杨曾文教授、魏道儒教授、文怀沙教授送花圈悼念净慧长老。
来自中国香港、中国台湾、澳大利亚、加拿大、美国、尼泊尔、匈牙利、日本、法国、德国等地的佛教团体、寺院也纷纷发来唁电，以各种方式对净慧长老的圆寂表示深切的哀悼。
中国佛教协会副会长刀述仁介绍了净慧长老生平。
追思大会上，中国佛教协会会长传印长老表示，净慧长老为禅宗的传承弘扬、佛教事业的健康发展和佛教文化的传播普及，贡献了毕生心血。净慧长老的圆寂是中国佛教事业的重大损失，希望广大佛教界人士和信众继承净慧长老遗愿，学习长老的悲智愿行，爱国爱教，发扬佛教优良传统。
国宗局蒋坚永副局长在致辞中表示，净慧长老是我国佛教爱国爱教的典范。长老一生坚持爱国爱教，拥护***的领导，坚持走与社会主义社会相适应的道路，认真贯彻和宣传宗教政策，行之所至，本着利益一方，服务一方，和谐一方，教化一方的宗旨，竭力促进社会和谐，是党和政府肝胆相照的真诚朋友。净慧长老的示寂是中国佛教事业的重大损失，希望广大佛教界人士和信众继承净慧长老遗愿，在党和政府的领导下，发扬佛教优良传统，适应时代进步要求，庄严国土，利乐有情，不断加强自身建设，精进不懈，进一步发挥在经济社会发展中的积极作用，为全面建成小康社会，实现中华民族伟大复兴的中国梦作贡献。
追思大会最后由净慧长老弟子明海法师致答谢词。明海法师表示，将永远传承并发扬净慧长老爱国爱教、弘法利生的精神，并代表治丧委员会工作班子对大家为净慧长老丧事所做的一切辛勤努力表示感谢。
9时30分，四祖寺为净慧长老举行荼毗法会，中佛协会长传印长老执拄杖说法并执举火。松纯长老、永寿法师、永信法师、明生法师、纯一法师、正慈法师等一一拈香祈福，四祖寺僧众以及四方佛子诸山长老、护法居士，各方善信虔诚念佛，告别净慧长老。